Tenk Tromsø ledes av en styringsgruppe som består av de fire partene: Tromsø kommune, Troms fylkeskommune, Statens vegvesen og Statsforvalteren i Troms og Finnmark.
Styringsgruppen er prosjektets øverste beslutningsorgan og består av hovedmedlemmer, varamedlemmer og observatører.
Hovedmedlemmer:
- Ingrid Dahl Hovland, vegdirektør Statens Vegvesen (leder)
 - Gunnar Wilhelmsen, ordfører i Tromsø kommune
 - Per Elvestad, Statsforvalter i Troms og Finnmark
 - Kristina Torbergsen, fylkesordfører i Troms fylkeskommune
 
Observatører i styringsgruppemøtene:
- Kari Helene Skog, Tromsø kommune
 - Pål Julius Skogholt, Tromsø kommune
 - Markus Akselbo, Tromsø kommune
 - Mari Siljebråten, Troms fylkeskommune
 - Benjamin Furuly, Troms fylkeskommune
 - Irene Dahl, Troms fylkeskommune
 
Sekretariatet skal koordinere og administrere samarbeidsprosjektet Tenk Tromsø. Sekretariatet ledes av Veronica Wiik, og består i tillegg av controllere Merethe Drivdal og Siw Hege Pedersen.